Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KATNA1O75449 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KATNA1O75449 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KATNA1O75449 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KATNA1O75449 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KATNA1O75449 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms