Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NIPSNAP2O75323 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NIPSNAP2O75323 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIPSNAP2O75323 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPSNAP2O75323 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIPSNAP2O75323 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms