Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2O75044 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRGAP2O75044 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP2O75044 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP2O75044 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP2O75044 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP2O75044 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms