Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MITFO75030 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MITFO75030 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MITFO75030 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MITFO75030 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MITFO75030 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MITFO75030 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MITFO75030 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MITFO75030 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MITFO75030 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MITFO75030 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MITFO75030 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MITFO75030 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MITFO75030 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MITFO75030 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MITFO75030 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MITFO75030 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MITFO75030 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MITFO75030 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MITFO75030 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MITFO75030 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MITFO75030 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MITFO75030 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MITFO75030 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MITFO75030 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MITFO75030 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MITFO75030 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MITFO75030 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MITFO75030 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MITFO75030 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MITFO75030 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MITFO75030 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MITFO75030 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MITFO75030 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MITFO75030 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MITFO75030 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MITFO75030 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MITFO75030 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MITFO75030 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MITFO75030 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MITFO75030 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MITFO75030 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MITFO75030 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MITFO75030 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MITFO75030 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MITFO75030 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MITFO75030 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MITFO75030 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MITFO75030 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MITFO75030 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MITFO75030 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MITFO75030 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MITFO75030 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MITFO75030 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MITFO75030 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MITFO75030 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MITFO75030 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MITFO75030 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MITFO75030 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MITFO75030 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MITFO75030 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MITFO75030 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MITFO75030 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MITFO75030 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MITFO75030 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MITFO75030 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MITFO75030 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MITFO75030 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MITFO75030 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MITFO75030 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MITFO75030 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MITFO75030 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MITFO75030 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MITFO75030 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MITFO75030 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MITFO75030 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MITFO75030 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MITFO75030 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MITFO75030 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MITFO75030 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MITFO75030 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MITFO75030 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MITFO75030 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MITFO75030 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MITFO75030 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MITFO75030 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MITFO75030 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MITFO75030 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MITFO75030 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MITFO75030 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MITFO75030 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MITFO75030 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MITFO75030 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MITFO75030 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MITFO75030 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MITFO75030 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MITFO75030 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MITFO75030 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MITFO75030 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MITFO75030 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms