Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLOD3O60568 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLOD3O60568 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLOD3O60568 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLOD3O60568 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms