Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP104O60308 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP104O60308 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP104O60308 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP104O60308 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP104O60308 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP104O60308 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP104O60308 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP104O60308 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP104O60308 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CEP104O60308 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP104O60308 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP104O60308 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP104O60308 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP104O60308 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP104O60308 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP104O60308 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP104O60308 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP104O60308 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CEP104O60308 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CEP104O60308 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP104O60308 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP104O60308 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP104O60308 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP104O60308 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP104O60308 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CEP104O60308 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP104O60308 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP104O60308 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP104O60308 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP104O60308 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP104O60308 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP104O60308 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP104O60308 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP104O60308 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP104O60308 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP104O60308 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP104O60308 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP104O60308 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP104O60308 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP104O60308 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP104O60308 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP104O60308 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP104O60308 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP104O60308 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP104O60308 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP104O60308 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP104O60308 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP104O60308 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP104O60308 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP104O60308 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP104O60308 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP104O60308 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP104O60308 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP104O60308 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP104O60308 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP104O60308 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP104O60308 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP104O60308 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP104O60308 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP104O60308 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP104O60308 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP104O60308 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP104O60308 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP104O60308 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP104O60308 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP104O60308 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP104O60308 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP104O60308 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP104O60308 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP104O60308 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP104O60308 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP104O60308 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP104O60308 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP104O60308 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP104O60308 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP104O60308 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP104O60308 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP104O60308 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP104O60308 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP104O60308 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP104O60308 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP104O60308 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP104O60308 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP104O60308 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP104O60308 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP104O60308 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP104O60308 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP104O60308 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP104O60308 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP104O60308 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP104O60308 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP104O60308 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP104O60308 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP104O60308 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP104O60308 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP104O60308 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP104O60308 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP104O60308 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP104O60308 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms