Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSNA1O43805 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSNA1O43805 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSNA1O43805 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSNA1O43805 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms