Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR1O43759 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNGR1O43759 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR1O43759 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR1O43759 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms