Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACTN4O43707 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ACTN4O43707 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACTN4O43707 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACTN4O43707 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN4O43707 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms