Protein–RNA interactions for Protein: O15266

SHOX, Short stature homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOXO15266 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOXO15266 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOXO15266 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOXO15266 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOXO15266 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOXO15266 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOXO15266 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SHOXO15266 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOXO15266 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOXO15266 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOXO15266 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOXO15266 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOXO15266 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOXO15266 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOXO15266 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOXO15266 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOXO15266 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOXO15266 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOXO15266 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOXO15266 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOXO15266 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOXO15266 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOXO15266 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOXO15266 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOXO15266 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOXO15266 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOXO15266 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOXO15266 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOXO15266 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHOXO15266 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOXO15266 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOXO15266 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOXO15266 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOXO15266 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOXO15266 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOXO15266 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOXO15266 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOXO15266 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOXO15266 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOXO15266 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOXO15266 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOXO15266 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOXO15266 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHOXO15266 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHOXO15266 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHOXO15266 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOXO15266 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOXO15266 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOXO15266 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOXO15266 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOXO15266 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOXO15266 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOXO15266 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOXO15266 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOXO15266 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOXO15266 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOXO15266 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOXO15266 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOXO15266 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOXO15266 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOXO15266 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOXO15266 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOXO15266 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOXO15266 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOXO15266 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOXO15266 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOXO15266 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOXO15266 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOXO15266 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOXO15266 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOXO15266 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOXO15266 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOXO15266 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHOXO15266 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHOXO15266 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHOXO15266 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHOXO15266 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOXO15266 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOXO15266 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOXO15266 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOXO15266 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOXO15266 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOXO15266 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOXO15266 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOXO15266 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOXO15266 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOXO15266 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOXO15266 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOXO15266 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOXO15266 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOXO15266 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOXO15266 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOXO15266 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOXO15266 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOXO15266 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOXO15266 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOXO15266 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOXO15266 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHOXO15266 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHOXO15266 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms