Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A1O15245 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A1O15245 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A1O15245 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A1O15245 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC22A1O15245 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A1O15245 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms