Protein–RNA interactions for Protein: O14730

RIOK3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK3O14730 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIOK3O14730 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RIOK3O14730 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIOK3O14730 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOK3O14730 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOK3O14730 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOK3O14730 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOK3O14730 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOK3O14730 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOK3O14730 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOK3O14730 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIOK3O14730 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIOK3O14730 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIOK3O14730 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RIOK3O14730 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK3O14730 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK3O14730 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIOK3O14730 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIOK3O14730 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIOK3O14730 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIOK3O14730 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIOK3O14730 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIOK3O14730 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIOK3O14730 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RIOK3O14730 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOK3O14730 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOK3O14730 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOK3O14730 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOK3O14730 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOK3O14730 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOK3O14730 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOK3O14730 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOK3O14730 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOK3O14730 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms