Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GFRA2O00451 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GFRA2O00451 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GFRA2O00451 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GFRA2O00451 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GFRA2O00451 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GFRA2O00451 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms