Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCRL2O00421 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCRL2O00421 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCRL2O00421 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCRL2O00421 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms