Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QW42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QW42 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QW42 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QW42 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QW42 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QW42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QW42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QW42 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QW42 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QW42 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QW42 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QW42 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QW42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QW42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QW42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QW42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QW42 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QW42 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QW42 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QW42 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QW42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QW42 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QW42 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QW42 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QW42 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QW42 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QW42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QW42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
J3QW42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
J3QW42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
J3QW42 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QW42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QW42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QW42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QW42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QW42 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QW42 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QW42 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QW42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QW42 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QW42 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QW42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QW42 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QW42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QW42 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QW42 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QW42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QW42 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QW42 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QW42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QW42 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QW42 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QW42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QW42 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QW42 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QW42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QW42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QW42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QW42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QW42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QW42 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QW42 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QW42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QW42 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QW42 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QW42 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QW42 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QW42 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QW42 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QW42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QW42 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QW42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QW42 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QW42 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QW42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QW42 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QW42 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QW42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QW42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QW42 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QW42 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QW42 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QW42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QW42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QW42 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QW42 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QW42 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QW42 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QW42 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QW42 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QW42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QW42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QW42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
J3QW42 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QW42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QW42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QW42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QW42 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QW42 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms