Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC01387J3KSC0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC01387J3KSC0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01387J3KSC0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01387J3KSC0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms