Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
CROCC2H7BZ55 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.01■■■■■ 4
CROCC2H7BZ55 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CROCC2H7BZ55 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CROCC2H7BZ55 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CROCC2H7BZ55 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CROCC2H7BZ55 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms