Protein–RNA interactions for Protein: H3BN98

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BN98 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BN98 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BN98 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BN98 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BN98 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BN98 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BN98 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BN98 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BN98 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BN98 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BN98 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BN98 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BN98 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BN98 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BN98 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BN98 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BN98 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BN98 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BN98 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BN98 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BN98 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BN98 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BN98 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BN98 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BN98 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BN98 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BN98 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BN98 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BN98 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BN98 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BN98 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BN98 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BN98 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BN98 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BN98 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BN98 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BN98 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BN98 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BN98 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BN98 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BN98 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BN98 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BN98 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BN98 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BN98 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BN98 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BN98 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
H3BN98 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BN98 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BN98 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BN98 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BN98 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BN98 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BN98 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BN98 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BN98 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BN98 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BN98 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BN98 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BN98 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BN98 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BN98 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BN98 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BN98 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BN98 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BN98 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BN98 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BN98 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BN98 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BN98 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BN98 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BN98 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BN98 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BN98 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BN98 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BN98 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BN98 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BN98 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BN98 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BN98 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BN98 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BN98 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BN98 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BN98 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BN98 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BN98 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BN98 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BN98 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BN98 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BN98 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BN98 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BN98 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BN98 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BN98 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BN98 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BN98 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BN98 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BN98 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BN98 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BN98 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms