Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BML4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BML4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BML4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BML4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BML4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BML4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BML4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BML4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BML4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BML4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BML4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BML4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BML4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BML4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BML4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BML4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BML4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BML4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BML4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BML4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BML4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BML4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BML4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BML4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BML4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BML4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BML4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BML4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BML4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BML4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BML4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BML4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BML4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BML4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BML4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BML4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BML4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BML4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BML4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BML4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BML4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BML4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BML4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BML4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BML4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BML4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BML4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BML4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BML4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BML4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BML4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BML4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BML4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BML4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BML4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BML4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BML4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BML4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BML4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BML4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BML4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BML4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BML4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BML4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BML4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BML4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BML4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BML4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BML4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BML4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BML4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BML4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BML4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BML4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BML4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BML4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BML4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BML4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BML4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BML4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BML4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BML4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BML4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BML4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BML4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BML4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BML4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BML4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BML4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BML4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BML4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BML4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BML4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BML4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BML4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BML4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BML4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BML4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BML4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms