Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGLL3A8MV65 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VGLL3A8MV65 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VGLL3A8MV65 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VGLL3A8MV65 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VGLL3A8MV65 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VGLL3A8MV65 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms