Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNCNA6PVL3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KNCNA6PVL3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KNCNA6PVL3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms