Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP27XA6NNY8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP27XA6NNY8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP27XA6NNY8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP27XA6NNY8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP27XA6NNY8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP27XA6NNY8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP27XA6NNY8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP27XA6NNY8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP27XA6NNY8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP27XA6NNY8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP27XA6NNY8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP27XA6NNY8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP27XA6NNY8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP27XA6NNY8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP27XA6NNY8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms