Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT8L1PA6NM43 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCT8L1PA6NM43 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCT8L1PA6NM43 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT8L1PA6NM43 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8L1PA6NM43 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms