Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A6NL46 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A6NL46 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A6NL46 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A6NL46 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A6NL46 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NL46 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NL46 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NL46 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A6NL46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A6NL46 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A6NL46 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A6NL46 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A6NL46 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A6NL46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A6NL46 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A6NL46 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
A6NL46 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A6NL46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A6NL46 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A6NL46 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A6NL46 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A6NL46 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A6NL46 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A6NL46 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A6NL46 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
A6NL46 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A6NL46 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
A6NL46 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A6NL46 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
A6NL46 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A6NL46 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
A6NL46 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
A6NL46 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A6NL46 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NL46 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NL46 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NL46 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NL46 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NL46 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NL46 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NL46 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NL46 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NL46 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NL46 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
A6NL46 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A6NL46 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NL46 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NL46 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NL46 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NL46 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NL46 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NL46 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NL46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NL46 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NL46 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A6NL46 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A6NL46 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A6NL46 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A6NL46 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NL46 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NL46 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NL46 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NL46 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A6NL46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NL46 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NL46 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NL46 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A6NL46 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A6NL46 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A6NL46 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A6NL46 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A6NL46 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A6NL46 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A6NL46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A6NL46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NL46 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NL46 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NL46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NL46 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A6NL46 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A6NL46 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A6NL46 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A6NL46 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A6NL46 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A6NL46 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A6NL46 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NL46 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NL46 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A6NL46 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A6NL46 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NL46 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NL46 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NL46 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NL46 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NL46 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NL46 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NL46 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NL46 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NL46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms