Protein–RNA interactions for Protein: A6NK97

SLC22A20, Solute carrier family 22 member 20, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A20A6NK97 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A20A6NK97 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A20A6NK97 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC22A20A6NK97 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A20A6NK97 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A20A6NK97 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms