Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC154A6NI56 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC154A6NI56 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC154A6NI56 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC154A6NI56 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC154A6NI56 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC154A6NI56 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC154A6NI56 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC154A6NI56 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC154A6NI56 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC154A6NI56 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC154A6NI56 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC154A6NI56 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC154A6NI56 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC154A6NI56 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC154A6NI56 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms