Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MAP1LC3B2A6NCE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP1LC3B2A6NCE7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAP1LC3B2A6NCE7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms