Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP69A5D8W1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP69A5D8W1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP69A5D8W1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP69A5D8W1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CFAP69A5D8W1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP69A5D8W1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP69A5D8W1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP69A5D8W1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms