Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms