Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms