Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms