Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND1Q9NSA2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms