Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms