Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SENP6Q9GZR1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP6Q9GZR1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms