Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN18Q96SJ8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms