Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R9BQ96SB3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms