Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC114Q96M63 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC114Q96M63 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms