Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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