Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CAVIN3Q969G5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms