Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDM1Q8NG50 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RDM1Q8NG50 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms