Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRACR2BQ8N4Y2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms