Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAAP20Q6NZ36 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms