Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.39□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 SNRNP200-204ENST00000480615 1646 ntTSL 511.11□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 IK-205ENST00000508301 868 ntTSL 210.64□□□□□ -0.712e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.771e-13■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 29.57□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 UBR4-216ENST00000494503 598 ntTSL 38.87□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.052e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 ELOA-203ENST00000609199 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.082e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP192-212ENST00000540847 2485 ntTSL 28.14□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 WDR1-218ENST00000515743 4482 ntTSL 57.91□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 IK-201ENST00000417647 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.212e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 GSE1-205ENST00000412692 6625 ntTSL 57.41□□□□□ -1.222e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 SFSWAP-202ENST00000535202 567 ntTSL 27.39□□□□□ -1.232e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 ZNF280B-202ENST00000619852 3981 ntTSL 1 (best)6.83□□□□□ -1.322e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.472e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP192-207ENST00000508539 451 ntTSL 55.84□□□□□ -1.472e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.482e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP192-215ENST00000589993 3284 ntTSL 55.7□□□□□ -1.52e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP135-201ENST00000257287 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.512e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.582e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.62e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP135-203ENST00000506202 5129 ntTSL 1 (best)4.96□□□□□ -1.612e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP192-208ENST00000510237 6548 ntTSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.652e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP192-211ENST00000513432 8635 ntTSL 1 (best)4.43□□□□□ -1.72e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.722e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 IK-202ENST00000502899 690 ntTSL 34.21□□□□□ -1.742e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.752e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP192-209ENST00000511820 6455 ntTSL 1 (best)3.42□□□□□ -1.862e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.932e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.952e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 DROSHA-213ENST00000511778 1261 ntTSL 32.79□□□□□ -1.962e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 RNF8-206ENST00000487950 731 ntTSL 42.74□□□□□ -1.972e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 DROSHA-221ENST00000514927 567 ntTSL 22.23□□□□□ -2.052e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 BAZ1B-203ENST00000466844 827 ntTSL 40.88□□□□□ -2.272e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.482e-6■□□□□ 11.3
NIPBLQ6KC79 KTN1-215ENST00000554567 730 ntTSL 524.34■■□□□ 1.492e-7■□□□□ 11.2
NIPBLQ6KC79 DAZAP1-209ENST00000590419 508 ntTSL 312.97□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 11.2
NIPBLQ6KC79 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 23.53□□□□□ -1.842e-44■□□□□ 11.2
NIPBLQ6KC79 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.51e-6■□□□□ 11.2
NIPBLQ6KC79 TOP2B-203ENST00000424225 3525 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.841e-6■□□□□ 11.2
NIPBLQ6KC79 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.31e-6■□□□□ 11.2
NIPBLQ6KC79 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.617e-7■□□□□ 11.2
NIPBLQ6KC79 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.817e-7■□□□□ 11.2
NIPBLQ6KC79 EPRS-204ENST00000477030 1526 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 11.2
NIPBLQ6KC79 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.261e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.11e-7■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 RB1CC1-208ENST00000521611 528 ntTSL 521.1■□□□□ 0.971e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 CPOX-205ENST00000515041 1030 ntTSL 220.88■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 CPOX-204ENST00000513674 826 ntTSL 520.25■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.761e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.73e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 RRP1-204ENST00000475534 588 ntTSL 319.22■□□□□ 0.671e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SLC30A5-204ENST00000504103 382 ntTSL 318.78■□□□□ 0.61e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SNRNP70-204ENST00000595231 1673 ntTSL 1 (best)18.36■□□□□ 0.533e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.533e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-7■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 517.92■□□□□ 0.461e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 POLR3GL-203ENST00000471706 755 ntTSL 517.74■□□□□ 0.431e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.391e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.371e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SNRNP70-209ENST00000601065 1757 ntTSL 317.35■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 PSPC1-204ENST00000492741 1709 ntTSL 217.11■□□□□ 0.331e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.31e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 GLUL-210ENST00000484996 1369 ntTSL 316.88■□□□□ 0.291e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 OTUB1-205ENST00000535140 638 ntTSL 316.77■□□□□ 0.271e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 BAG6-257ENST00000462875 972 ntTSL 216.51■□□□□ 0.231e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 216.44■□□□□ 0.221e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 ZNF432-204ENST00000598446 862 ntTSL 316.29■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 PSPC1-202ENST00000427943 866 ntTSL 516.24■□□□□ 0.191e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 SNHG12-203ENST00000464115 712 ntTSL 316.08■□□□□ 0.161e-19■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 CTDSP2-207ENST00000551594 900 ntTSL 315.53■□□□□ 0.081e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 CYHR1-206ENST00000526887 1012 ntTSL 315.25■□□□□ 0.031e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 PSPC1-203ENST00000471658 1647 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.021e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.011e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-6■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 01e-5■□□□□ 11.1
NIPBLQ6KC79 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 11.1
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 53.1 ms