Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WHAMMP3Q1A5X7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WHAMMP3Q1A5X7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms