Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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TNXAQ16473 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXAQ16473 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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