Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 UBE2Z-204ENST00000506498 766 ntTSL 412.58□□□□□ -0.44e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RIPOR3-201ENST00000045083 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.414e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 TCF25-206ENST00000562193 627 ntTSL 312.42□□□□□ -0.424e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SND1-212ENST00000485871 597 ntTSL 312.35□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PAQR3-207ENST00000511594 2288 ntTSL 511.91□□□□□ -0.54e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.514e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.514e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 KXD1-216ENST00000601630 1327 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.584e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.664e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HCFC1R1-206ENST00000574151 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.694e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PAQR3-208ENST00000512299 597 ntTSL 410.66□□□□□ -0.74e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SERPINB9-201ENST00000380698 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SARAF-211ENST00000522794 808 ntTSL 58.51□□□□□ -1.054e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.184e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SARAF-204ENST00000518296 878 ntTSL 27.68□□□□□ -1.184e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PAQR3-212ENST00000515853 3370 ntTSL 1 (best)6.3□□□□□ -1.44e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SARAF-212ENST00000523127 735 ntTSL 56.16□□□□□ -1.424e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.474e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 ZFPM2-204ENST00000518180 596 ntTSL 45.28□□□□□ -1.564e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PDZD8-204ENST00000489491 289 ntTSL 23.92□□□□□ -1.784e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PKM-214ENST00000565143 2301 ntTSL 1 (best)13.21□□□□□ -0.32e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.341e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.861e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.872e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.692e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.452e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.92e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 TLK1-203ENST00000409443 2783 ntTSL 216.31■□□□□ 0.21e-25■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-25■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-25■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.591e-25■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MINK1-210ENST00000574871 3150 ntTSL 211.82□□□□□ -0.528e-7■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.454e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.334e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.324e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MRPL37-203ENST00000398219 868 ntTSL 314.8□□□□□ -0.044e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.944e-7■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 DENND4B-202ENST00000368646 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.03□□□□□ -0.324e-7■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.55e-7■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 BAG6-259ENST00000464869 488 ntTSL 216.41■□□□□ 0.221e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.066e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SRRT-213ENST00000611405 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.46e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.426e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.426e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 OBSL1-215ENST00000604031 1774 ntTSL 217.86■□□□□ 0.457e-13■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 ESPN-204ENST00000434576 750 ntTSL 315.59■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 GPX3-206ENST00000521632 1314 ntTSL 517.05■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 20
PCBP1Q15365 CHPT1-210ENST00000552351 1524 ntTSL 229.91■■■□□ 2.389e-11■■■■□ 20
PCBP1Q15365 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.239e-11■■■■□ 20
PCBP1Q15365 CHPT1-204ENST00000549128 1552 ntTSL 528.96■■■□□ 2.239e-11■■■■□ 20
PCBP1Q15365 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.179e-11■■■■□ 20
PCBP1Q15365 CHPT1-206ENST00000550385 754 ntTSL 511.67□□□□□ -0.549e-11■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LTBP3-218ENST00000530866 3756 ntTSL 212.6□□□□□ -0.399e-11■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SMARCD2-210ENST00000584400 1017 ntTSL 330.22■■■□□ 2.432e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.231e-11■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.792e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.682e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.673e-8■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.62e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-215ENST00000450019 1689 ntTSL 524.66■■□□□ 1.542e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SMARCD2-206ENST00000577990 449 ntTSL 324.57■■□□□ 1.522e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 MYL12A-212ENST00000608786 738 nt23.98■■□□□ 1.432e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.412e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.392e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.382e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.342e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.322e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ASF1B-203ENST00000589468 587 ntTSL 322.34■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LARP4B-212ENST00000614908 1826 ntTSL 422.19■■□□□ 1.142e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.12e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)21.72■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 MAPK12-210ENST00000497738 2021 ntTSL 1 (best)21.72■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SRSF2-201ENST00000358156 572 ntTSL 420.9■□□□□ 0.942e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.922e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.892e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 COQ8A-209ENST00000489044 941 ntTSL 320.57■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 E2F4-208ENST00000567007 2615 ntTSL 220.35■□□□□ 0.851e-11■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PCMTD2-211ENST00000610196 476 ntTSL 320.18■□□□□ 0.823e-8■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-218ENST00000567606 2042 ntTSL 1 (best)20.12■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 E4F1-203ENST00000563643 793 ntTSL 320.02■□□□□ 0.82e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.792e-6■■■■□ 20
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