Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LSAMPQ13449 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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