Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A2Q01362 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A2Q01362 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms