Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK16Q00536 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms