Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms